総合振興局

総合振興局直轄

• 総務課
• 課税課
• 納税課

地域創生部

• 地域政策課
• 地域政策課新幹線推進室

保健環境部

• 保健福祉室
• 社会福祉課
• 八雲地域保健室
• 児童相談室
• 環境生活課

産業振興部

• 商工労働観光課
• 農務課
• 渡島農業改良普及センター
• 渡島農業改良普及センター渡島南部支所
• 渡島農業改良普及センター渡島北部支所
• 農村振興課
• 林務課
• 水産課
• 渡島西部地区水産技術普及指導所
• 渡島中部地区水産技術普及指導所
• 渡島北部地区水産技術普及指導所

函館建設管理部

• 函館建設管理部
• 建設指導課

森林室

• 東部森林室
• 西部森林室

出先機関

• 八雲食肉衛生検査所
• 渡島家畜保健衛生所