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総合振興局各課・出先機関

総合振興局直轄  
総務課/課税課/納税課
地域創生部  
地域政策課/地域政策課新幹線推進室
保健環境部   
保健行政室/社会福祉課/環境生活課/八雲地域保健室/児童相談室
産業振興部
商工労働観光課/農務課/渡島農業改良普及センター/農村振興課/林務課/水産課/渡島西部地区水産技術普及指導所/渡島中部地区水産技術普及指導所/渡島北部地区水産技術普及指導所
森林室 
東部森林室/西部森林室
建設管理部
函館建設管理部
出先機関
渡島家畜保健衛生所/八雲食肉衛生検査所